寶誠(chéng)生物助力安徽省阜陽市疾控中心順利完成國(guó)內(nèi)第一臺(tái)MK1C測(cè)序儀裝機(jī)測(cè)序
2020-04-29
2020年4月19日至21日，寶誠(chéng)生物完成了國(guó)內(nèi)Nanopore新款測(cè)序儀MK1C在安徽省阜陽市疾病預(yù)防控制中心的裝機(jī)任務(wù)。在3月27-28日，我公司就積極響應(yīng)阜陽疾控中心關(guān)于盡快落實(shí)測(cè)序系統(tǒng)投入疫情防控的要求，提前投入了一臺(tái)MinION測(cè)序儀，并進(jìn)行了詳細(xì)的實(shí)驗(yàn)和生信分析培訓(xùn)。由于前期已經(jīng)過詳細(xì)的培訓(xùn)，所以本次MK1C的裝機(jī)過程非常順利。在此特別感謝阜陽市疾控中心相領(lǐng)導(dǎo)、檢驗(yàn)科卜科長(zhǎng)、郭老師、張老師等對(duì)我們工作的支持?？吹剿麄?yōu)榱艘咔榉揽刈汾s工作進(jìn)度，檢驗(yàn)科的老師吃住在單位，做到樣本隨到隨做，這種忘我的實(shí)干精神深深感染了我們，我司技術(shù)支持也臨時(shí)調(diào)整優(yōu)化了安裝培訓(xùn)方案，進(jìn)行穿插式培訓(xùn)，每天與客戶一起工作到凌晨1點(diǎn)多，得到了用戶的充分肯定與好評(píng)。在本次裝機(jī)培訓(xùn)中心，阜陽疾控中心應(yīng)用科技K0212新冠全基因組捕獲試劑盒進(jìn)行新冠病毒的全基因組捕獲，SQK-LSK109 1D試劑盒連接法文庫構(gòu)建，成功完成了對(duì)新冠病毒樣本的全基因組測(cè)序并上傳BIGD國(guó)家基因組科學(xué)數(shù)據(jù)庫，基因組覆蓋度超過99.5%，為戰(zhàn)疫推進(jìn)做出自己的貢獻(xiàn)。實(shí)驗(yàn)結(jié)束之后老師表示Oxford Nanopore的MK1C測(cè)序儀的便攜與實(shí)時(shí)性，該設(shè)備的投入使用，能大大加強(qiáng)他們對(duì)于本次新冠疫情的變異分析及溯源工作，同時(shí)對(duì)于常規(guī)檢測(cè)無法確定的未知微生物致病源，可以很好地解決這個(gè)問題，提供很多檢測(cè)方向的思路，鑒于目前的檢測(cè)結(jié)果非常令人滿意，他們表示馬上開始下一批次樣本的實(shí)驗(yàn)檢測(cè)。Nanopore測(cè)序具有實(shí)時(shí)性、長(zhǎng)讀長(zhǎng)的特點(diǎn)，目前實(shí)際操作中讀取的最長(zhǎng)DNA片段長(zhǎng)度大于2Mb。此外，nanopore可以直接測(cè)序DNA和RNA，不需要PCR擴(kuò)增，使得測(cè)序無擴(kuò)增偏差。而nanopore的文庫制備簡(jiǎn)單，測(cè)序儀便攜，可以攜帶至現(xiàn)場(chǎng)進(jìn)行測(cè)序等特點(diǎn)，真正意義上做到了使任何人在任何地點(diǎn)都可以進(jìn)行測(cè)序這樣的理念。Oxford Nanopore是一家技術(shù)型公司，公司針對(duì)通量大小推出以下測(cè)序產(chǎn)品，分別是：Flongle，MinION, MinIONMK1C，GridION和 PromethION. 公司注重技術(shù)的開發(fā)，現(xiàn)有員工300余人，涉及多重學(xué)科和領(lǐng)域。針對(duì)不同的應(yīng)用領(lǐng)域，Nanopore有不同的指導(dǎo)方案?，F(xiàn)階段，Nanopore測(cè)序儀在微生物耐病毒耐藥性及致病性，環(huán)境研究，植物研究，癌癥研究，臨床研究，微生物組，轉(zhuǎn)錄組分析等領(lǐng)域都有大量的應(yīng)...[+查看詳情]
