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寶誠生物首席技術(shù)毛凌峰博士受邀在第三屆國際獸醫(yī)檢測診斷大會做ONT測序應(yīng)用報告

2022-06-28

第三屆國際獸醫(yī)檢測診斷大會暨亞洲獸用醫(yī)療器械及藥品展覽會6月25日在杭州盛大開幕。2021年第三屆國際獸醫(yī)檢測診斷大會邀請了中國、美國、英國、荷蘭、澳大利亞等10多個國家81位演講嘉賓,在3天內(nèi)分享92場主題報告,參會代表2398人。


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現(xiàn)場展臺


 現(xiàn)場共有參展商138家,其中重量級儀器耗材生產(chǎn)商參展商例如正大集團、世紀(jì)元亨、金諾百泰、美國伯樂、基、天隆科技、博日科技等皆有參展??梢钥吹将F醫(yī)檢測診斷會議絕大多數(shù)展品隸屬于自動核酸提取儀及試劑、實時熒光定量儀及試劑、各種動物抗體原理檢測試劑,以及其他類似離心機、移液器、管與槍頭等分子實驗室常用設(shè)備與耗材。

 寶誠生物作為Oxford Nanopore Technologies授權(quán)經(jīng)銷商與廠家共同參展。Nanopore納米孔測序儀是全場唯一亮相的測序儀設(shè)備廠家,其他測序儀生廠商及其設(shè)備并未出現(xiàn)。作為全場唯一測序儀廠家的ONT受到許多參會人員的咨詢與期待。


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       Oxford Nanopore Technologies還在現(xiàn)場展示了其重磅產(chǎn)品——GridION。


  GridION為中通量的三代測序儀,是一款極具成本效益的小型臺式系統(tǒng),提供按需測序,并帶有集成實時數(shù)據(jù)處理功能。GridION具有同時或單獨運行五張測序芯片的能力,可為繁忙的實驗室和服務(wù)提供商提供經(jīng)濟高效的長讀長實時納米孔測序優(yōu)勢。集成的高性能數(shù)據(jù)處理減輕了對復(fù)雜IT基礎(chǔ)架構(gòu)的需求。


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主題報告

 第三屆國際獸醫(yī)檢測診斷大會邀請了中國、美國、英國、荷蘭、澳大利亞等10多個國家81位演講嘉賓。主題報告主要涉及:

 豬(豬流行性腹瀉、藍(lán)耳病、豬瘟診斷、豬丁型冠狀病毒)

 禽(雞重要呼吸道傳染病、禽免疫抑制病、家禽診斷、空氣樣本檢測病原、禽流感、禽腺病病毒)

 牛羊(牛結(jié)核病、牛病毒性腹瀉、羊病診斷、結(jié)節(jié)性皮膚病、牛白血病病毒、犬新孢子蟲、牛布魯氏菌?。┮约吧贁?shù)寵物類診斷領(lǐng)域。

 涉及診斷的演講嘉賓使用技術(shù)大部分涵蓋了病理切片、抗原抗體檢測、實時熒光檢測以及測序技術(shù)。

 其中一個比較可喜的現(xiàn)象是中國動物疫病預(yù)防控制中心的劉洋教授在演講中展示了第三代納米孔測序技術(shù)在快速檢測(8h)、長度長以及宏基因組組裝方面的優(yōu)勢,并且展示了ONT準(zhǔn)確度98%的最新更新??梢娔壳吧鐣{米孔測序技術(shù)的錯誤認(rèn)識逐漸更正。


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  我司毛凌峰博士在會議中分享納米孔測序技術(shù)在動物疫病方面的應(yīng)用,提高了納米孔測序技術(shù)知名度,講座結(jié)束后吸引了一大波感興趣的潛在客戶前往Oxford Nanopore Technologies展臺。


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 報告中毛博分享了利用納米孔測序技術(shù)對非洲豬瘟(ASFV)進行快速全基因組測序的文章“Rapid Sequence-Based Characterization of African Swine Fever Virus by Use of the Oxford Nanopore MinION Sequence Sensing Device and a Companion Analysis Software Tool”。該研究重點介紹了Nanopore 測序技術(shù)與 ASF-FAST 軟件的結(jié)合使用,目的是快速、實時地從診斷樣本中分離出完整的 ASFV 基因組。


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     Nanopore 技術(shù)與 ASF-FAST軟的使用,能夠?qū)崟r識別和表征 ASFV。通過將納米孔技術(shù)與快速測序試劑盒結(jié)合使用,結(jié)合富集處理和自動化分析,該研究最早在測序開始后 6 分鐘就成功識別了 ASFV 特異性序列讀數(shù),成功富集的高質(zhì)量樣本可以在測序開始后的 10 分鐘內(nèi)生成代表高達(dá) 100% 的基因組的可操作原始數(shù)據(jù)。




非洲豬瘟樣本利用Nanopore測序最快在10分鐘內(nèi)獲得全基因組覆蓋序列



納米孔測序和其他測序技術(shù)在ASFV檢測時間對比

 目前PCR的檢測速度更快且成本更低,因此它仍然是篩選樣品的首選測試。但是測序具有更強的檢測能力可以提供更豐富的數(shù)據(jù),能夠發(fā)現(xiàn)PCR檢測無法提供的突變信息。與Sanger測序和NGS測序相比,Nanopore的速度優(yōu)勢是毋庸置疑的。 

 該研究表明,納米孔技術(shù)是一種重要的工具,可用于在世界上許多地方和地區(qū)進行快速監(jiān)測,這些地點和地區(qū)面臨著 ASFV 的重大風(fēng)險。納米孔測序平臺可在進行測試的地區(qū)、沒有復(fù)雜基礎(chǔ)設(shè)施的實驗室以及現(xiàn)場直接使用,結(jié)合開發(fā)的 ASF-FAST 配套軟件,可以在幾分鐘內(nèi)獲取數(shù)據(jù)。這對于疾病爆發(fā)時的有效應(yīng)急管理至關(guān)重要,可以減少經(jīng)濟損失并加快疾病控制干預(yù)。


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